يقوم القسم التعليمي بوضع الخطط و البرامج اللازمة لتنفيذ السياسة التربوية والتعليمية الخاصة بالتوحد بما يتناسب مع القدرات الفكرية للطفل ومتابعة الحالات و التقييم، كما تهدف هذه البرامج إلى تدريب الأطفال على متطلبات الحياة الاجتماعية ومهارات الحياة اليومية وتقسم فيه الفصول إلى :
فصل التدخل المبكر :
وهو أول فصل يلتحق به الطفل، ويتراوح عمره في هذا الفصل ما بين 3 إلى 6 سنوات، ويركز هذا الفصل على تقديم خدمات متنوعة اجتماعية وتربوية ونفسية لأطفال التوحد ، بالإضافة لتنمية الجانب الاستقلالي ومهارات العناية الذاتية وتعزيز التفاعل الاجتماعي، كما يساهم في تطوير مهارات أولياء الأمور وقدراتهم لمساعدة أطفالهم على النمو والتعلم.
الفصل التحضيري أو التمهيدي :
هي المرحلة التالية بعد التدخل المبكر وتتدرج من تمهيدي أول إلى تمهيدي ثان حسب تطور الطفل، و هو امتداد لخدمات فصل التدخل المبكر لكن لمن هم أكبر سناً.
الفصل الأكاديمي :
يلتحق بهذا الفصل من لديه قدرات ومهارات تؤهله للتعليم وفق منهج التعليم العام أو منهج التربية الفكرية ويتم من خلاله وضع الخطة التعليمية لكل طفل على حسب قدراته.